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世界地图，一架飞机从纽约飞到了香江；随后飞机的图标消失，火车的图标出现在银幕上，向着北方而去，在地图上划出一道红色的轨迹。
地图与真实的画面叠在一起，火车的图标与真实的火车重叠。地图与火车图标渐渐淡去，真实的画面出现在观众眼前，一列轰隆咆哮绿皮火车沿着铁轨，在苍茫的大地上前行。
镜头切到火车内，车厢里挤满了乘客，墙壁上电风扇呼哧呼哧的响着，让喧闹的车厢显得更加嘈杂。张纯如抱着着包坐在硬板床上，看上去非常憔悴，又有些委屈，就像受了欺负的孩子。
镜头切到南京站，火车从左侧开到画面中，然后缓缓停住。全景，张纯如拖着行李从火车上下来，好奇地打量着周围的一切。大全景，张纯如的周围都是人，他们顺着月台浩浩荡荡地往前走。人群中的张纯如看上去有些孤单，又有些无助。
镜头切到车站外，张纯如在路边拦了一辆出租车，然后用半生不熟的中文告诉司机，去南京大学西苑宾馆。汽车缓缓启动，然后顺着街道在南京城里穿行。汽车停住，张纯如打开车门从车上下来。
镜头切到西苑宾馆的走廊里，大全景，张纯如拖着行李箱迎着镜头慢慢走来。就在张纯如走到镜头前，即将于镜头擦肩而过之时，摄影机转动，对准了张纯如的后背。张纯如在一道房门前停住，用钥匙打开了房门，并走进了房间。镜头切到房间里，张纯如放下行李，拉开了窗帘。她坐在床上，重重呼了口气，然后倒了床上。镜头切到窗外，外面碧空万里，太阳喷洒着猛烈的光线。
咚咚的敲门声响起，穿着大花低胸晚礼服的张纯如整了整礼服，将门打开。三个中年人走了进来，他们告诉张纯如，他们是杨夏鸣、孙宅魏，以及王卫星教授，将为张纯如的这次南京之行提供帮助。
三位教授问张纯如，张纯如在吗？张纯如笑着告诉他们，我就是张纯如。三位教授非常惊讶，他们以为“美国作家”张纯如应该是个中年人，没想到是个年轻姑娘，简直像一名大学生！三人面面相觑，有一种我们是不是在浪费时间的感觉。
王卫星问张纯如：“你为什么要写这本书？”
张纯如非常严肃地道：“屠杀犹太人，这件事全世界家喻户晓，但是在美国，在西方，南京大屠杀的事实无人知晓。作为一个中国人的后裔，写出它是我的责任。”
三位教授被这话打动了，而张纯如带的资料更是扯淡打消了他们的不信任。张纯如带来了《魏特琳日记》的复印片段，这是国内学界第一次知道《魏特琳日记》的存在。她在美国图书馆复印了1000多页有关远东军事法庭审判的资料，而这些资料在国内已经遗失。
张纯如简述了此次来南京的目的，并提出了具体的要求：一是采访南京大屠杀幸存者；二是实地察看当年的屠杀地点和当年外国人居住的房屋；三是收集并翻译中文档案资料。
三位教授作了分工，由王卫星收集整理资料，杨夏鸣担任翻译，孙宅巍还找来了遇难同胞纪念馆副馆长段月萍，她对幸存者的住址比较了解，有她出面方面张纯如采访幸存者。
镜头切换，张纯如在孙宅巍、段月萍和杨夏鸣陪同下前往当年大屠杀的现场。挹江门纪念碑前，张纯如静静站在那里，陷入沉思，汗水浸湿了她的头发和t恤；与此同时，电影画面的画面叠化出当年大屠杀发生时的场景，日军用机枪对着人群猛烈扫射，成批的中国人纷纷倒下，哀号之声回响在荒凉的江岸……
接下来，张纯如他们去了中山码头、煤炭港、草鞋峡……
每到一处张纯如都会停下来，将自己代入大屠杀发生时的情形；而观众通过叠化出来的画面，也都看到了当初日军如如何疯狂屠杀中国人的。
镜头切回到西苑宾馆，窗外已经是漆黑一片。张纯如站在一张1937年的南京地图前，双眼盯着地图，在地图上进行标注：“江东门一万人被杀；燕子崖五万人被杀；草鞋峡五万七千人；煤炭巷三千人；鱼雷营九千人；中山码头一万人……”
华人和中国记者不必说，现场的美国记者和观众都这一串串的数字惊呆了。张纯如的声音不大，但她念出的这一个个数字却像一把铁锤，敲击在所有人的心上，让观众的心紧缩成一团，并不断下沉。
张纯如走到桌子前，坐在椅子上，重重呼了一口气，然后看着笔记本怔怔出神。
镜头切换，张纯如在杨夏鸣的陪同下走进南京师范大学随园校区。杨夏鸣告诉张纯如，金女大的旧址就在这里，那些建筑都保存完好。
南京师范大学校园里树环抱，遮天蔽日，里面都是飞檐峭壁式古典建筑，点缀在绿树丛中充满江南的味道。银幕前的观众惊讶的看到电影里的大草坪、以及中央楼、科学楼、艺术楼等建筑都完好无损的保留着。古老的建筑静静的矗立着，像在无声的诉说过过往的一切。
张纯如走到艺术楼的门前，轻轻推开了大门。就在房门推开的一刹，现场观众都微微一愣，房间里正在说话的魏特琳和程瑞芳猛然看向镜头，像看到了银幕前的观众似的。不过观众们马上反应过来，在房门推开的一瞬，时间又回到了1937年。
镜头切换，一个小男孩气喘吁吁地道：“华小姐！华小姐！东瀛鬼子来了！他们有好多人！可能有几百人！你快去看看吧！”
魏特琳听到这话，脸上现出一片忧色，赶紧往大楼外面走。程瑞芳把那个送信的孩子叫道跟前，叫他跑步去中心楼和各宿舍楼，把东瀛兵到来的消息告诉工作人员。要他们确保年轻妇女和女孩们不要露面，也不要喧哗。那孩子立刻去了。程瑞芳也走在大楼，快步追赶魏特琳去了。
魏特琳走出大楼不久，就看到一个中佐带领着一伙东瀛军人来了。魏特琳让他们进了办公室，叫仆人倒了茶。程瑞芳通过窗户看了眼，校园内拥进了有一百多东瀛兵，悄声告诉魏特琳：“校园里现在有很多他们的人。”
这些军人一坐下，胖脸的中佐就自我介绍说，他是谷寿夫指挥的第六师团后勤部副部长。中佐说，他们需要魏特琳他们的合作。翻译是个四十多岁的胖子，帮他翻译着，其他三个军官喝着茶。魏特琳道：“如果你们的要求合理，我愿意帮助你们。”
中佐哼哼一笑，继续道：“我们打算在士兵当中加强纪律。自从攻下南京，我们的部队在不长的一段时间里变得不太守规矩，主要是因为皇军在紫金山战斗中失去了很多弟兄，所以无法控制复仇的行动。现在，他们平静下来了，是建立秩序、实现城内和平的时候了。我们将恢复娱乐业，这样就需要一些女人。”
翻译把他的话一翻译完，魏特琳就坚决地道：“我们这里没有那种女人。”
“根据我们的情报，你们难民营里边有一些妓女。”中佐继续道，“我们是来征召她们的，还会给她们发执照，这样她们在娱乐男人的同时又可以挣钱养活自己。”
魏特琳道：“我没发现难民中间有任何妓女。”
“我们可以轻易地认出她们，这个你不必担心。另外，你不觉得这是保护像这位一样的良家妇女最有效的方式吗？”中佐看着魏特琳，用威胁的口气道，“我们的士兵都是年轻力壮的家伙，需要女人帮他们放松放松。如果没有女人，我们是很难保证你们的安全的。”
那肿眼泡的翻译在把中佐的话翻译完后，停顿了一下，看着魏特琳道：“魏特林小姐，这是命令，争辩是徒劳的。”
魏特琳不知道该怎么办，东瀛人真能看出妓女和良家妇女的区别吗？他们要是选错了人怎么办？而且他们可能会故意选漂亮的良家姑娘！魏特琳征询地看看程瑞芳，但程瑞芳没有说话，她也不知道如何是好。
魏特琳犹豫了好一阵，艰难地道：“我不知道你们怎么能看出来谁从前干那种工作。”
中佐听到这话知道魏特琳服软了，发出得意地狂笑：“不必担那个心。我们在这方面很有经验，可以看出她们来，非常准确。”
魏特琳道：“不过，我有一个条件，那些女人一定得是自愿重操旧业的。”
中佐笑道：“当然，除此之外，她们还可以得到很好的报酬。”
魏特琳叹了口气道：“如果是这样，你们可以找她们。”
突然，外边传来女认的尖叫，接着，四处响起了叫喊声。魏特琳以及现场观众都意识到就在他们说话的时候，东瀛兵已经闯进校园抓人了！同时也意识到，那个中佐是故意把魏特琳拖在这里，好让他的手下去抓人。
魏特琳站了起来，快步走到窗户边朝外张望。外边的东瀛兵正在拖走一些年轻姑娘，被拖走的，都是身材不错和相对漂亮的。很多姑娘都在哭喊，高呼救命，拼命想要挣脱，但两三个东瀛兵拖着，她们根本挣脱不掉。
一个模样清秀的姑娘死死抱住艺术楼前石狮子的前腿，尖叫着不肯放手。一个东瀛兵在她肚子上猛击了两拳，把她打得松开了手，然后将他拖走了。一个梳着两把刷子辫的小女孩追着他们，大声喊着“姐姐！姐姐”，可两个年岁大些的女人把她拉住了。观众认出了那个姑娘是美兰，而那个小女孩是她妹妹美如。
魏特琳浑身发抖，猛地转身冲中佐喊道：“这是绑架！我要到你们上司那里去抗议。”
中佐轻蔑地一笑：“随你的便。”说着把头一摆，羊皮手套一挥，趾高气扬地走出办公室，他手下的人都跟着他离开了。
魏特琳跌坐在椅子里，哭了起来：“上帝啊，我干了什么！我根本就不该让他们去挑女人。我怎么会这么蠢啊？”
“在你答应之前他们就已经开始抓人了。”程瑞芳一边哭，一边安慰道，“就算你不允许，他们还是会抓人的，这不是你的错。”