日本武士本有规定，非经藩主允许，不许擅离藩国。否则，将触犯“脱籍”之罪，将被藩主从藩内武士中除名。
这一后果是相当严重的。武士不劳而获，靠藩主提供俸禄。因此，在日本做武士，相当于在满清做官。一旦武士脱籍，就像在满清丢了官，不仅于名誉有辱，连生计都将受到影响。
这一情况，在日本开国后发生了重大变化。外国势力进入中国，幕府、各藩无力抵御，威信大减。
与满清一样，日本民间日益凋敝，武士俸禄大受影响。武士擅自离藩，到江户、长崎、大阪等大城市闯荡，也就成了一件见怪不怪的事。
井伊直弼在全国兴起大狱，试图到长州藩捕捉吉田松阴。以此为导火索，吉田松阴的弟子们，一群年轻气盛的武士，秘密来到横滨，准备刺杀井伊直弼背后的靠山-中国驻日公使陈至立。
6月10日夜，以伊藤博文、高山晋作、久坂玄瑞为首的长洲籍年轻武士，秘密来到横滨租界，准备刺杀中国驻日公使陈至立。
陈至立本是杨烜派来的特使，负责处理萨摩事件。但萨摩事件引发了连锁反应，包括将军继嗣、天皇密诏、安政大狱等。
日本形势大变，德川幕府风雨飘摇，有倾颓之忧。帝国对日本形势很关注，决心继续扶持德川幕府，改派陈至立为驻日公使，长驻横滨。
陈至立长袖善舞，俨然已是横滨外国使团的意见领袖。日本攘夷派武士视外国外交官为眼中钉、肉中刺，陈至立首当其冲，受到攘夷派武士的忌恨。
这晚，长洲藩刺客潜入横滨外国租界，沿围墙翻入中国公使馆。由于萨摩事件，日本与外国关系紧张，不时有武士冲击外国使馆。中国公使馆同样戒备森严，在围墙上安装了铁丝网、铃铛等防御设施。
长洲藩武士早有预谋，两名武士趴在围墙铁丝网上，充当肉盾，供同伙翻墙。他们身着武士腹甲，但胳膊、大腿还是被铁丝网刺穿了，鲜血直流。尽管这样，这两名充当肉盾的武士依然咬紧牙关，毫不退缩，催促同伴翻墙。
围墙上的铃当声很快惊醒了公使馆内的卫兵。卫兵们一边摇响警报，一边打开煤气灯，一边吹出急促的哨声。这种哨声代表有敌来袭，是级别最高的警报。
中国驻外公使馆驻有一个排的卫队，编制在革命军陆军。这一排革命军，代表革命军保护中国驻外使馆，从陆军中精挑细选而来，属于精英中的精英。
卫队人数虽少，却完全采用革命军的制度。这段时间，日本与外国关系紧张，公使馆卫队也进入三级战备，人员枪不离身，高度戒备。
当高山晋作等武士冲向公使馆大门时，卫兵当机立断，开枪射击。煤气灯全开，发出刺眼的光芒，把院内照得如同白昼。
日本武士武器简陋，除了武士刀，就是几支英国造米涅步枪。帝国生产的左轮手枪行销海外，日本武士亦持有几把手枪。
卫兵都是久经战阵的革命军老兵，平时制定有防暴恐袭击的预案，亦根据预案进行了多次演练。因此，长洲武士突袭公使馆，卫队并不紧张，根据预案展开，利用防御工事阻击日本刺客。
日本武士亦谋划已久，久坂玄瑞带六个武士从正面进攻，掩护高山晋作。高山晋作则带着另外六个武士，称为奇兵组，直奔公使馆主楼。他们已经侦知，中国公使馆一楼住卫兵，领事和文员都在二楼以上房间办公、居住。围墙处另有两名武士，负责接应大家撤退。
在此之前，日本武士曾多次谋刺外国使节。不管是英国，还是美国，还是法国，各国公使馆防守松懈，武士屡屡得逞。
久坂玄瑞等人都是长州藩的名士，对此次行刺志在必得。就算谋刺不成，也可以从容撤退。
然而，一开始就非常不顺。革命军卫队火力很猛，久坂玄瑞等人被步枪、手枪压制得抬不起头，很快就有两人中弹身亡。久坂玄瑞既是吉田松阴的弟子，也是他的女婿，对吉田松阴最为忠诚，行刺之心最为坚决。
但在革命军绝对的火力面前，武士的勇气根本不值不提。不仅久坂玄瑞等人动弹不得，高山晋作这组奇兵亦无法得到掩护，不能进入公使馆。
更多的革命军卫队反应过来，或守卫大门，或在阳台上居高临下，瞄准武士射击。
武士们才一露头，就被卫队步枪、手枪打得死伤惨重。再拖下去，武士就要全军覆没了。
久坂玄瑞大喝一声：“扔火弹！”这些火弹数量有限，本打算等冲入使馆内后再使用。如今情况紧急，只能把珍贵的手榴弹扔出来，以制造混乱。
围墙上的两名武士，已被铁丝网刺得血肉模糊，亦跌跌撞撞地冲向公使馆大门。按计划，他们负责守卫围墙，接应刺客撤退。
他们见同袍有难，擅离围墙，就意味着大家已无退路，只能与敌人同归于尽。这两个武士行动不便，目标暴露，很快被革命军卫队击毙。
众武士悲从心起，把手中的火弹用力抛出。趁着火弹造成的混乱，久坂玄瑞击中了一盏煤气灯。煤气灯爆炸，使馆少了一盏煤气灯，院子晦暗不少。
久坂玄瑞趁机带队冲向公使馆大门，与中国卫兵近战格斗。高山晋作则率领着奇兵组，与伊藤博文等残存的四人砸破窗户，直奔二楼而去。
楼道里灯火已灭，高山晋作刚刚冲上二楼，一名卫兵抢了过来，举枪瞄准为首的高山晋作。砰得一声，高山晋作中弹，跌倒在地。
卫兵亦非常悍勇，穿过高山晋作，试图堵住楼梯，防止武士上窜。谁知道，高山晋作没有死，抽出武士刀砍中了卫兵的大腿。卫兵吃痛，跪倒在地，顺手击毙高山晋作。
伊藤博文则赶了上来，一刀劈死卫兵。他只有16岁，却从小刻苦训练，已是一名武艺高强、勇敢无畏的武士。但他经验不足，有勇无谋，捡起枪支就往前冲。
卫兵的勇猛，为二楼的卫兵赢得了时间。就在这短短的几十秒内，二楼的卫兵已经各就各位，完成了部署。伊藤博文正要向上攀爬，就被乱枪打成了筛子。
奇兵组还剩两名武士，但高山晋作已死，奇兵组群龙无首，已经无能为力。二楼灯火全灭，只剩楼道里还有残存灯光。两名武士心智已乱，不顾一切地冲了上去。
卫兵守在楼道两旁，听到急促的脚步声后，从楼道两侧闪出，乱枪打死了两名武士。
一分钟后，二楼再无动静。二楼卫兵留下五人守卫楼道，其余四人冲下一楼，会同一楼的卫兵，阻击来访的刺客。
卫兵皆为百战之余的革命军老兵，使用口哨传递口令，彼此密切配合，顺利全歼日本武士。
参与刺杀行动的长洲籍武士共用有十六名，被击毙十三名，两名重伤，一名轻伤。