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虽然中左右三处战场皆败，但小笠原忠真并没有慌乱，他命令弓足轻向中军追击的夏军射击，意图以此阻挡夏军追击的步伐，同时命因为敌我即将陷入近战而停止射击的火炮与投石机再次射击。
这一次，重火力将不分敌我向中军的夏军进行攻击，而中军试图追击的夏军也在弓足轻的密集箭雨和火炮、投石机的打击下不得不停止追击，让日军终于有喘息的机会，能够收拢败军。
夏军的强大让小笠原忠真和原本信心满满的宫本伊织都傻了眼，尤其是宫本伊织，他在战前推断出来的夏军的弱点虽然都是正确的，但是……这实在和他想的完不一样啊？
为什么夏军能够顶着箭雨继续站在原地射击？
为什么夏军能够硬生生抗下骑兵的冲锋，即便是被大量伤亡后还是能够继续战斗下去？
为什么在被卷入与武士的白刃战后伤亡惨重，夏军还是能够鼓起勇气反攻？
他就算是想破脑袋，也想不通其中的原因。
就算是日本最强大的军队，也没办法做到这一切吧……
所以，在宫本伊织看来，这场失败其实并不冤，至少让他们明白了自己面对的敌人不是以往认知内任何一支军队能够比拟的，要知道即便是半个多世纪前的壬辰战争，同样是汉人组成的军队，明军的战斗力可没这么逆天。
「家督大人，依臣下所见，目前最好的选择还是撤离这里，不要继续与夏军作战。」想到这，他对着身前的小笠原忠真低声提议道。
小笠原忠真此时也已经心生撤军的念头，他的确有些害怕了，这要是继续打下去，能不能打得过夏军还是一回事，要是把大部分兵力都折损在里面，他肯定会被幕府责难的。
如果这场战争发生在岛原之乱之前，那他一定会意志坚定的督促军队继续与夏军作战，就算把大部分兵力都折损在里面也毫不足惜，毕竟那时候的九州各藩主大名都是不尊幕府的地方势力，可在岛原之乱后，九州的地方势力几乎都被扫清，北九州的藩主都是忠于幕府的人。
就在小笠原忠真陷入迟疑的时候，夏军战线开始缓缓重组，预备队代替了右翼被日军几乎撕碎的战线，那些浑身浴血的士兵们在预备队袍泽的目送下相互搀扶着撤往后方。
他们在撤往后方的同时，还对着那些接替自己的袍泽鼓舞汉化，一名腹部有一道伤口的士兵一边捂着伤口不让肠子流出来，一边对着队伍里自己认识的同乡喊道：「贼你妈，记得帮老子报仇，多杀几个倭奴。」
「晓得，你好好滚回去养病，老子会提着倭奴的头去看望你的。」那同乡回答道，他话音刚落，就被队伍里的连长一脚踹在了身上，骂道：「目视前方，注意军纪。」
当预备队的将士们顶上，站在血腥的右翼战场时，他们都被眼前的惨烈景象惊到，右翼战场上几乎血流成河，随处可见死状各异的日本武士与夏军步兵，日本武士主要死于枪伤，但也有许多人身上能够明显地看出刺刀刺入的伤口，那伤口深可见底，刺刀在拔出来后，还顺带将里面的脏器一并勾了出来。
在那一地的尸体中，还不时能够看见没有彻底死去的伤兵，夏军伤兵都被一同带走，因而还躺在尸堆里的就只有受伤的日本人，他们痛苦地发出微弱的呻吟声，还有人用尽力将手举起，想要让别人发现并救治自己。
但夏军的仁慈不会留给这些敌人，在得到长官的允准后，部分士兵离开队伍，走到这些还未彻底死去的日本人身前，在后者哀求、悲凉、绝望的目光中，将刺刀高高举起，随后毫不犹豫刺入了对方的要害部位，解决对方的痛苦，
夏军战线重组后，马度随即下令吹响进攻号角，向被他们击退的日军发起反攻，随着激昂
的号角声响起，同时也打破了小笠原忠真的迟疑，他眼见夏军主动推进，终于下定决心，鸣金收兵。
得到撤退的命令后，日军如蒙大赦，也顾不上那些难以搬运的投石机了，直接将投石机暴力拆除，关键零件摘除，随后逃也似的撤离战场，马度见日军撤退，本来还想派出骑兵追杀袭扰，但一见骑兵只有千人，还是没有冒这个险。
日军虽然撤退，但也并没有忘记他们的使命，在小笠原忠真的率领下撤入最近的有智山城，并以山城为核心，在有智山周围设下营帐，意图以此阻挡住夏军继续向内陆进军的路线。
虽然夏军能够直接绕过有智山城，继续深入九州岛内陆，但有智山城的位置着实很尴尬，能够直接切断夏军的补给线，而且山城一带的日军还保存了一定的战斗力。
若是不拔除这座山城，一旦夏军继续深入，日军就可以直接冲出来将他们的补给线切断，如果运气更不好一点，碰上了幕府的援军，那可就陷入重围之中了。
因此，马度只能下令军在有智山城周边设置营帐，与山城周围部署的日军大营陷入对峙。
有智山城城如其名，坐落于一座名为有智山的小山山顶，和大部分日本城堡一样易守难攻。
更可气的是，夏军的火炮因为角度和高度问题，无法直接从山脚下向山城展开炮击，夏军因此空有重火力却无法用于实战，只能派遣步兵强攻山城，以火药将城门炸开，再冲入城内肉搏。
考虑到不仅在靠近山城的时候会遭到夏军的密集火力阻截，就算攻入城内，也无法与日军那战技娴熟的武士肉搏取胜，马度顿时放弃了这个速战速决的方法，他寄希望于长时间围困山城，让城中日军陷入弹尽粮绝的困境，最终将其困死。
在那之前，夏军要先击败在山城周围部署的日军，日军虽然经过岩屋之战折损了数千人，但还保持着一定的规模和战斗力——虽然日军的士气的确出现了不稳定，尤其是武士大量阵亡，足轻缺少足够的弹压的情况下，不少足轻开始生出逃跑的念头。
马度虽然不清楚这一点，但作战经验丰富的他已经能够推断出来日军经过如此之重的伤亡，其士气定然会饱受打击，因而只要夏军趁势追击，日军顷刻间就会被击败。
三月初十，经过一天的修整，夏军再次向日军发起挑战。
为了能够一举击败日军在有智山山脚的部队，马度率军倾巢而出，从多个方向向日军营帐发起进攻，战斗随着12磅步兵炮的炮击而被拉开序幕。
随着炮声响起，修整一天而神采奕奕的夏军将士按照军鼓鼓点，踩着整齐的步伐向前推进，那从炮出的炮弹呼啸着直接落入日军杂乱的营地之内，顿时掀翻数片营帐，将躲在里面的日军士兵砸成碎块，引起一阵大的混乱。
「敌袭！夏军开始进攻了！」
「起来！都给我起来，拿上你们的武器，准备战斗！」
日军营地一片混乱，个子矮小的足轻们慌乱地不断奔跑，不时有炮弹落入混乱的人群之中，将多个倒霉的足轻砸得粉碎，那飞溅的血肉和残肢更加引起周围人的惊慌。
炮声也震惊了山城内的小笠原忠真，他在听到炮声后猛地从榻榻米上跳起来，也顾不上穿鞋子，快步冲出房间，等他跑出天守时，他的家老宫本伊织已经开始组织驻扎在山城内的武士部队。
见小笠原忠真到来，宫本伊织行了一礼，面色严肃地说道：「家督大人，夏军发起进攻了，驻扎在有智山下的足轻肯定无法抵挡夏军的攻势，还请家督大人随我移阵山下进行督战！」
「走！」小笠原忠真焦急地说道，而在这时，宫本伊织发现了他赤裸着的双脚，他连忙将自己的鞋子脱下，为小笠原忠真穿上
，一边说道：「家督，山路不平，还请穿上臣下的鞋子。」
小笠原忠真见状，顿时面露感动，但他并没有拒绝，接受宫本伊织的伺候，换上了他的鞋子，同时，忠真问道：「长次呢？如此重大的事情，长次怎么不在这里。」
「回家督大人，臣下已经派人前去请长次大人来了，想必他现在应该正在往这边赶来。」
宫本伊织话音落下，身着甲胄的小笠原长次就朝着这边一路小跑过来，他同样神色严峻，没有去理会周围看到他对他怒目而视的武士，一直跑到忠真面前，行了一礼，道：「总大将大人，长次已经准备就绪，只为了将功赎罪。」
他口中的将功赎罪，是因为他在岩屋之战中抛弃部下突围逃命的事情，虽然他的举动没有立花忠茂那般恶劣，但在武士心中还是抛弃部下背叛了他们，因而那些从战场上撤下来的武士在看见他以后，都会对他怒目而视。
而立花忠茂虽然临阵脱逃，但也并没有摆脱战死的命运，他在逃跑的时候被一名轻步兵狙击重伤，撤入有智山城后只坚持了几个时辰，便痛苦地死在了床上。
「好！」忠真点了点头，他下令道：「军随我下山，迎击夏军！」
「嗨！」
众人齐声应道。