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对于敢于起义，响应王师的义军首领，朱成功以友善的态度对待。
他本就是出生于日本的归国侨民，在并入苏言序列之前，他的军队就是靠着对外贸易事业维持运作，与海外华侨、华商保持着密切关系，自然会对吕宋侨民充满亲近。
登上旗舰的几位义军首领一开始还战战兢兢，对面见一位郡王而充满紧张，但在与朱成功交谈过后，对方的和善让他们放松了许多。
而且，几位义军首领和侨居吕宋的汉人中有许多人来自闽南，同乡与同乡之间感情也更加深厚。
三言两语间化解了几位义军首领的紧张后，朱成功便开始将话题引入正题，询问几人马尼拉当地的情况和西夷驻军力量。
在听闻马尼拉城驻军仅有不过千人，且军纪散漫，战意并不高昂后，朱成功心中对攻克马尼拉城更加充满了信心，他信誓旦旦地对着义军首领和在场的文官武将们说道：
「吕宋之地，吾势在必得，西夷土人欺压侨民久已，当取其地，去其人，以血还血，以牙还牙。」
随后，夏军尽数登陆吕宋岛，在马尼拉城外整军列阵，期间城中的西班牙军队也逐渐恢复了秩序，在西班牙总督的命令下有序对城中的土人与汉人移民展开镇压。
土人只不过一群乌合之众，在西班牙军队的镇压下很快土崩瓦解，死伤众多，而汉人移民虽然保持了一定的纪律和秩序，但终究还是没有接受过专业的军事训练，且战且退，只能撤回城中的汉人聚集地凭借街道固守。
他们将大量的家具从各自家中搬出，堆积在街道上作为障碍，延缓西班牙军队的进攻速度，他们躲在障碍后和屋顶上，用火绳枪、弓弩、标枪甚至是石头还击，在汉人的顽强抵抗下，西班牙军队死伤颇多，只能暂时停止进攻。
得知汉人反抗激烈的消息后，西班牙总督曼利克本来准备调去大炮炮击汉人聚集地，但他又担心一旦城外夏军攻入城内，自己下达这个命令将会遭到极为残酷的报复，他因此一时间有些投鼠忌器，不敢下令。
就这样，时间到了第二日，第二日清晨，夏军便对圣地亚哥堡与马尼拉城发起强攻，汉人义军没有参加战斗，他们被要求在后方作为辅兵即可。
即便曾经有过攻打西式棱堡的经验，但夏军还是在马尼拉城下吃了亏，只要抵近城墙，夏军将遭到四面八方射来的子弹，许多士兵战死在城墙底下。
而夏军从船上卸下来的火炮对准城墙炮击后，只能在城墙上留下一个微乎其微的痕迹，棱堡保持一定倾斜的墙面设计使得炮弹的弹开率提高了许多。
为此，夏军只能冒险将黑火药运到城墙底下，以大量火药强行炸开城墙，就在朱成功即将下达这个军令时，一名义军首领却阻止了他，后者声称自己曾经在酒后从一个关系密切的西班牙驻军士兵口中得知圣卢西亚门的旁边有一个常年虚掩着的小门，若是驻军遗忘了这个小门没有将其关上，夏军就能够先一步从小门潜入城中。
朱成功听了那名义军首领的话后，当即命人前去查看，并向那名义军首领许诺，若是小门真的是虚掩着的，夏军能够以此攻入城内，他会赐予重赏。
过了许久，被朱成功派去查看的人才终于来报，那个门的确存在，因为所在的位置并不显眼，所以他们找了很久才找到，那个小门的确是虚掩着的，里面黑洞洞，不知道通往哪里。
如果是苏言在这里，那他一定会想起1453年的那场灾难性的攻城战，罗马人就是因为忘记将一道小门关上，才让奥斯曼军队得以攻入城内，时至今日，远在东方的西班牙人居然没有吸取这个教训。
不管怎么说，确定小门真实存在后，朱成功当即下令从军中挑选数百名精锐战兵，以甘
辉为将，从那道小门杀入城内，夺取城门，迎接城外主力入城。
甘辉随即领命而去，他身着重甲，手持斩马大刀，亲自带头进入小门内，甘辉不愧为郑氏麾下第一猛将，他率领的军队顺着小门杀入城内，出现在了圣卢西亚门的守军身后，杀了守军一个猝不及防。
西班牙守军然没有想过夏军居然会突然出现在城内，在猝不及防的情况下很快就被杀得溃不成军，仓皇而逃，甘辉亲自手持斩马大刀将一名还欲抵抗的西班牙士兵拦腰斩断，那喷溅出来的鲜血和内脏令其余西班牙人胆寒，口中高呼「恶魔」，向城中跑去。
随后，甘辉部接管了圣卢西亚门，打开城门迎接城外主力入城，眼见城门打开，朱成功立即下令吹响进攻号角，大军杀入城内。
接下来的战斗无需再用笔墨点缀，殖民地驻军本就以军纪散漫著称，眼见夏军大举杀入城内，不愿丢掉性命的他们纷纷四散而逃，让夏军得以长驱直入，直取西班牙殖民地总督府。
眼见夏军杀入城中，西班牙总督曼利克面色煞白，知道大势已去，只能以总督的名义下令城中士兵放下武器，他带头向夏军投降。
武安三年九月十四，西班牙总督宣布投降，马尼拉城与圣地亚哥堡落入夏军手中，吕宋各地西班牙驻军在听闻消息后也都先后放下武器，等候夏军接管。
曼利克没有调去火炮炮击汉人聚集地的选择为他赢得了一个好结局，但那些曾经欺压屠杀过汉人的西班牙士兵和移民就没那么幸运了，他们在被指认出来后，分批关押，并在市中心公开处死。
当然，这是后面发生的事情了，曼利克满脸苦涩的在投降协议上签下了自己的名字，随后就和部分幸运儿和西班牙移民一同被送上了离开马尼拉的商船，他站在商船甲板上，看着逐渐远去的城池，没有去想那些没能离开的士兵和移民的下场，缓缓闭上了眼，思考自己未来的命运。
除了西班牙士兵和移民外，当地土人也遭到了夏军的铁腕镇压，曾经参与过暴行的土人部落一个接一个遭到灭族，土人的鲜血染红了吕宋岛的土地，他们直到死之前的那一刻，才终于意识到自己曾经犯下了多大的错误。