严关一战，清军兵败如山倒，在明军的驱赶下，无数溃散的清军向着南面的大榕江狂奔。然而孔有德率领着三千王府卫队，在逃至大榕江畔就驻马停了下来。
孔有德不甘心就此失败，因此并没有打算直接退回桂林，而是准备凭借大榕江天险，以自己精锐的王府卫队逆战。
此时，溃败的清军正络绎不绝地向着这里汇聚而来，后面追击的明军将士，一心只想着尽快追上清军，不放一个敌人渡江，早已顾不上阵型。这正是孔有德期待已久的机会，他决定利用王府卫队精骑突袭，一举击溃明军前锋。
见明军追至，孔有德亲率三千王府卫队从斜地里如风驰电掣般冲杀出来，向着明军侧翼就是一阵乱砍。
正当明军前锋眼看就要抵挡不住的时候，远处一队战象踏着沉重的步伐赶了上来，随着战象凄厉的嘶鸣声陡然响起，清军坐骑顿时浑身战栗，不顾骑兵的指令惊恐地原地打圈，瞬间乱成了一团。
与此同时，定国亦亲率五千精骑加入了战阵，只见定国坐跨“二斗金”，手执梅花枪，飞驰疾进，在安西元帅大纛的指引下，明军精骑紧随其后，直取孔有德的帅旗。
见定国转瞬即至，孔有德也只能硬着头皮挥刀迎了上去。然而孔有德毕竟已经是五十岁的年龄，加上许多年没有上阵与人搏杀，哪里是定国的对手，只战了不到五个回合，就被定国一枪刺中右臂，翻身跌落马下。
定国正欲上前一枪结果了这个大汉奸，谁知一旁数十名孔有德的亲兵见主将落马，顿时如疯了一般，一拥上前，将定国团团围在中间厮杀。趁此机会，孔有德慌忙从地上爬起，抛下厚重的甲胄，飞身重新跃上战马，头也不回地向着桂林方向仓惶逃命。
待后面的明军精骑赶上，杀散这股清军，孔有德早已逃得是无影无踪了。
随着孔有德逃跑，清军在大榕江畔最后的反击也就此落幕，在明军恣意追杀下，溃散至此的清军残部皆被斩尽杀绝，孔有德仅以身免，急入桂林，闭城死守。
桂林乃是南疆重镇，方圆数十里，光是城门就多达十三座，坚固异常。
但孔有德此时已是穷途末路，他只能将所剩无几的守军布防于城中几处关键要害，又将城中百姓尽数驱赶上城，参与防守。
此外，孔有德又派人向南宁的提督线国安、柳州的全节和梧州的马雄求救，妄图依托坚城，固守待援。
不过远水解不了近渴，孔有德还没来得及等到援军，定国已经率领大军抵达了桂林城下。明军各营随即将桂林里三层外三层，围了个水泄不通。
站在城上往下望去，只见围城明军甲仗耀日，旌旗蔽野，钰鼓之声更是震天动地，孔有德惊得是浑身冒汗，心慌意乱。
且说马进忠率部抵达桂林城西南的武胜门外，见在此防守的清军主将竟是自己的老相识王允成，当即纵马来到城下，向着城上呼喊起王允成的名字。
王允成不敢贸然答话，连忙前往告知孔有德，孔有德听后一脸愕然，自知城中兵力单薄，抵挡不了多久，犹豫再三方才说道：“你且暂时出去应答，看那马进忠说些什么，再回来告诉本王。”
回到武胜门，王允成俯身靠在城墙垛口上，向着马进忠打了声招呼。
见是王允成，马进忠旋即大声劝说道：“乐安兄，多年未见，别来无恙？吾等皆是大明臣子，何必要为满清鞑子卖命？如今我十万大军围城，孔有德已是穷途末路！我家元帅说了，只要兄台愿意反正归明，过去之事既往不咎，咱们兄弟依旧是不能分开的‘王、马’！”
这王允成本是左良玉副将，号称“铁骑王”，由于素与马进忠交好，军中皆将二人合称为“王、马”。当初左梦庚降清，王允成与马进忠并没有选择跟从，而是去往湖南投靠了何腾蛟，授封岳阳伯，驻防岳州。待清军南下进攻湖南时，王允成见清军势大，遂开城投降了孔有德。
王允成心里明白此战毫无胜算，破城只在旦夕之间，但他心中仍抱着一丝幻想：“葵宇兄，兄弟我当日已然降清，若今日再回头降明，世人将如何看待我王允成？再说广西不是湖南！桂林也不是宝庆！定南王更不是续顺公！桂林城池坚不可摧，援军转瞬即至，我又岂能轻易投降？”
马进忠知道王允成所言不过是自欺欺人罢了，于是继续劝说道：“正所谓识时务者为俊杰，当日兄台降清乃是迫不得已，亦是情有可原！然如今人心思明，王师所到之处，莫不望风归降，我军不日便将克复江南，饮马长江，兄台此时来附，尚为时不晚，不失为中兴之功臣！若再有迟疑，大军攻城在即，桂林城中有多少兵力，兄台想必比我清楚，怕是等不到各处援军赶到，城池就要易主！机会转瞬即逝，还望兄台三思！”
王允成低头沉思了良久，终于拿定了主意。就在这时，忽有传令兵匆匆赶来，说定南王召他前往王府，有要事相商。王允成知道孔有德定然也是为此事找他，连忙转身走下城楼，上马直奔王府。
果不其然，见到王允成，孔有德当即开门见山地向他询问起与马进忠谈话的内容。王允成不敢隐瞒，一五一十地将马进忠的话重新复述了一遍，孔有德听后瞬间陷入了沉默。
“王爷，李定国兵强马壮，末将估计咱们怕是很难撑到援军到来，如今摆在面前的就只有两条路可走！请王爷速做决断！”王允成不知孔有德心里到底有何想法，只能试探地询问道。
“你且说说，是哪两条路？”孔有德心乱如麻，随口问了一句。
王允成硬着头皮说道：“一是继续固守待援，直至城破殉国！二是回头是岸，重新归附大明！除此之外，再无第三条路可走了！”
孔有德听后忍不住一声苦笑道：“回头？本王手上沾满了鲜血，哪里还有回头路可走？”
“王爷差矣，想想当初的李成栋，弘光、隆武两个皇帝皆死于他手中，更是屠杀江南军民百余万，然而一旦反正归明，不也照样封侯拜将么？王爷乃堂堂大清定南王，若肯反正，亦不失封王矣！”王允成看出孔有德起了投降的心思，连忙压低声音，小声劝了一句。
孔有德却是摆了摆手：“李成栋是在永历走投无路之际选择反正归明的，与今日局势不可同日而语，如今本王手中一无兵马，二无地盘，就这么向李定国投降，不过徒添羞辱罢了！”
见孔有德迟疑不决，王允成知道桂林迟早易手，遂决定派人悄悄缒城而出，前往马进忠营中与其联络，表示愿为内应。
此时正值盛夏时节，广西气候酷热难耐，明军在桂林城下休整一日，直到傍晚时分，定国方才将冯双礼和马进忠召至帐中议事。
听闻马进忠与授封二等阿思哈哈番爵位的清将王允成乃是故交，定国立刻对其言道：“白日里暑热难耐，本帅念及严关一战将士们太过辛苦，故并未传令攻城。如今夜色将至，敌军神经紧绷一日，此时必然松懈！马叔，既然你与王允成相熟，当尽快与其联络，以为内应，如此方能减少大军伤亡，确保万无一失！”
马进忠笑着说道：“元帅放心，今日王允成已派人前来接洽投降事宜，末将让信使回去告知王允成，让他见机行事，不要急于行动，以免暴露！”
正在说话间，天空中突然电闪雷鸣，紧接着一场大雨便在帐外哗哗倾泻下来。等到骤雨初歇，已是夜晚时分，定国背手走出帐外，深吸了一口空气中泥土的清香，随即抬头凝视夜空，对着身旁的冯双礼和马进忠说道：“孔有德在两广屠戮我大明军民，血债累累，现在终于能够报仇雪恨了！传令下去，城中清军凡有不降者，皆杀无赦！”
随着战鼓声隆隆响起，明军迅速从四面八方向着桂林城发起了攻击，一时间在漆黑的夜空中，星火喷射飞溅，铳炮轰鸣，杀声震天。
激战正酣，忽有王允成穿箭射书城外，明军士卒很快将书信送至马进忠手中，马进忠展信一看，心中窃喜，立刻按照王允成信中所标明的攻击路线，集中兵力猛攻武胜门。
明军将士冒着雨点般的箭矢，在城墙下方架起登城梯，前仆后继地奋力向城上攀爬。不断有人中箭跌落，但还是有越来越多的明军将士跳上城头，与城墙上的清军展开激战，八旗参领芮城功、骁骑校周志元等相继被明军斩杀。
听闻武胜门摇摇欲坠，孔有德急忙亲自赶来督阵，见定南王的旗号高高立于城墙上方，本已濒临崩溃的清军士气顿时复振，双方几经厮杀，明军支撑不住，被迫退下城去。
随着天边渐渐发白，明军仍未夺下城池。
天亮后，定国并没有下令鸣金收兵，而是将昨夜参与攻城的各营相继撤换下来，用先前没有参战的部队顶上，重新发起进攻。
这场惨烈的攻坚战从黑夜打到白天，又从白天打到天黑，再从天黑战至了凌晨时分，虽然桂林城依旧掌握在清军手中，但在明军不间断的车轮战下，守城清军整整两夜未曾合眼，早已是疲惫不堪了。
城墙上协防的百姓见清军无暇顾及，纷纷丢下兵器，逃下城去。
就在桂林城防即将土崩瓦解的时候，一名上山割草的明军士卒意外发现，在桂林城北郊有一个溶洞能够直接通往桂林城内的北山之上。
定国闻报大喜，立即命陈玺率五十名精心挑选出的精壮步卒，趁着夜色悄悄潜入城中，于子时前后攀上北山，并在山顶之上树起了明军的旗帜。
七月初四日拂晓时分，郭有名率一百名敢死队悄然攀上城头，与守城清军展开了殊死搏杀。与此同时，北山上的明军也纷纷摇旗呐喊，为城墙上方的敢死队助威。
正在武胜门督战的孔有德见居然有明军扎营于城内北山之巅，不禁大惊失色，没有防备城下一箭飞来，正中前额，顿时血流如注。
孔有德知道最后的时刻即将来临，他彻底放弃了抵抗的决心，捂着额上的伤口颓然走下城楼，步履蹒跚地向着王府的方向走去。
这几日孔有德一直都在武胜门督战，王允成始终没有找到合适的机会，如今见孔有德离开，王允成立即命令部下打开城门，迎马进忠入城。
见明军破城而入，防守于各处城门的清军也都在瞬间失去了抵抗的意志，纷纷放弃城守，四散溃逃。